1990年9月在克羅埃西亞獨立聲勢升高的時候,在塞爾維亞邊界靠近波士尼亞赫塞哥維納的周邊地區這些塞爾維亞人佔多數的地區成立了塞爾維亞克拉伊納共和國。另一方面西斯拉弗尼亞地區(克羅埃西亞東部的地區)也成立了東斯拉弗尼亞·巴拉亞·西斯雷姆自治組織(en:Eastern Slavonia, Baranja and Western Srem),為了讓此地區暫時外於兩國的武力衝突所以表示不讓克羅埃西亞警察軍進入而被同意成立。
6月25日克羅埃西亞發表獨立宣言後,克羅埃西亞警察軍和留在克羅埃西亞境內的居民零星的發生衝突。9月22日時南斯拉夫聯邦軍襲擊克羅埃西亞首都札格雷布,正式開始變成克羅埃西亞和塞爾維亞正規軍的戰爭。戰爭最激烈的地區是多數塞爾維亞人群居且靠近塞爾維亞的斯拉弗尼亞地區。這個地區的居民因為民族的不同而從鄰居一瞬間反目變成仇家,居民拿起武器就互相攻擊的險惡情況。其中和斯拉弗尼亞的武科瓦爾(Vukovar)和沿著多瑙河一河相隔的伏伊伏丁那之間有長達87天的巷戰,稱為弗科瓦戰爭(en:Battle of Vukovar),雙方都有近3000人的死亡,這場戰役有被拍成電影驚變世界。