新生的禹挺立在天地之間，他的光芒照亮了三界，他身上散發出一種奇異的力量，比元氣更充沛，比罡氣更猛烈，比劍氣更銳利，比正氣更剛硬。那高高端坐在天國禦座上的天帝，也被禹的力量所震撼，主動任命他爲治理洪水的總指揮。
禹效仿曾祖父黃帝，在會稽山會合天下神祗。巨人防風氏遲到，禹責怪他不遵守號令，立斬不赦。防風氏身材巨大，受戮後一節骨頭就裝滿了整輛車子，禹的威權和神力可想而知。
禹率領衆神向人面、蛇身、赤發的共工二世開戰。共工二世從西方掀騰起洪峰，淹沒了整個中原大地。禹運大神通，飛擲開山神斧，劈開群山，使滔滔洪水從山谷間奔涌直下。共工二世力怯失勢，逃回北方封國。禹一路追踪，在昆侖之北與共工二世的部將相繇狹路相逢。
相繇是一條九頭巨蛇，人首而蟒身。它貪暴無饜，常常同時張開九張大嘴，吞盡九座大山的動物，啃光九座大山的植被，使林茂草豐的山嶺化作寸草不生的荒丘，造成水上流失；無論何地，被它伸頭一抵、張口一吐，即成一片澤溪，澤溪裏的水又苦又辣，人飲用了會喪命，禽獸蛇蟲也不敢靠近。
禹運斧如風，頃刻斬落相繇的九顆頭顱，從相繇的斷頸內，九股污血噴誦而出，漫延成血的沼澤，腥臭沖天，五穀不生。禹用泥土來填塞這片血沼，誰知填塞三次，塌陷三次。禹索性把這地方挖掘成一個大池塘，用挖起的泥壘成土墩，替五方之帝修築了五座祭台。
趕跑了共工二世，誅殺了九頭蛇相繇，降伏了人臉虎軀、八首八尾八脚的水怪天昊及各路河妖洪魔以後，禹按照山川形勢，運用堵塞與疏導相結合的方法，領導人民抵禦洪水，重建家園。爲了徹底解除洪澇威脅，禹親自端土筐，揮撅頭，開掘了三百條大河，三千條支流，不計其數的小溝渠，以溝通四夷九州、五湖四海。
洪水平息，大功告成，禹想測量一下大地的面積。他命令手下神將太章、竪亥一個從東極一步一步量到西極，一個從南極一步一步量到北極，量得的長度都是五億十萬九千八百步。
禹平治洪水，使天下人民安居樂業，黎民百姓感謝他，各國首腦敬佩他，這時侯，堯早已逝世，舜也已老邁，大家都擁戴禹繼承帝位。舜對禹說：“完成治水大業是你的大功，謙虛、勤奮、節儉是你的大德。我褒揚你的大德，贊美你的大功，帝位相繼相承的次序應在你身上，你終當晋升爲帝。”舜向各國首腦和人民宣告，由禹攝行天子之政。
舜不顧年老體弱，堅持赴各地巡視，不幸中途病逝于南方的蒼梧之野。噩耗傳來，百姓如喪父母，他的夫人娥皇、女英更是肝腸寸斷。她們急忙坐車乘船。赴南方奔喪，一路上珠泪滾滾，抛灑在竹林間，竹子上沾滿了斑斑淚痕，認此，南方就有了斑竹，也叫湘妃竹。
娥皇、女英行船至湘水，風波陡起，雙雙溺水而亡，魂魄化爲神，人稱湘君、湘夫人。舜的尸首由當地百姓用瓦棺裝撿，埋彜在蒼梧九嶷山的南坡。
