南北韓以及國際學術界認為東北工程利用歷史維護現實利益,對此表示反對並認為是對朝韓歷史文化的偷竊("stealing of Korean History")與掠奪 ("usurp a key component of Korea's history")。[7] 哈佛大學高麗研究院博士後馬克·拜因頓(Mark Byington)認為東北工程的觀點是當今中國民族主義的自然產物,是以現代的眼光理解歷史以維護現實利益,從學術上講是錯誤的("historically flawed")。東北工程的觀點不僅在國際上受到批評,在中國國內也是遭到異議。